El Subprograma de Acciones Integradas se fundamenta en los acuerdos de cooperación bilateral suscritos con cada uno de los países participantes en el mismo y promueve la colaboración entre dos equipos de investigación, español uno y de un segundo país el otro, a través de proyectos de I+D conjuntos, de duración determinada y con objetivos concretos, en las áreas de conocimiento contempladas en el Plan Nacional de I+D+I (2008-2011).

Podrán ser solicitantes y beneficiarios de las ayudas que se concedan al amparo de este subprograma los Centros de I+D, sin ánimo de lucro (Centros Tecnológicos y Centros de apoyo a la innovación tecnológica, Centros privados de investigación y desarrollo universitarios o sin ánimo de lucro, Organismos públicos de investigación, las universidades públicas y otras entidades privadas sin ánimo de lucro: fundaciones, asociaciones u otras entidades no lucrativas que realicen habitualmente actividades relacionadas con el fomento, la gestión y la intermediación en el campo de la ciencia, la tecnología, la investigación y la innovación.

La convocatoria es anual, durante el primer semestre del año. Los países que participan y las áreas temáticas seleccionadas pueden varias de una convocatoria a otra. En la convocatoria 2009, participan en el subprograma los siguientes países: Alemania, Argentina, Austria, Francia, Italia, Portugal y Sudáfrica.