En el Subprograma INNOEUROPA las ayudas se conceden bajo la modalidad de subvención. Estas ayudas se destinan a financiar las actuaciones necesarias para conseguir un incremento sustancial de los retornos económicos del 7PM con respecto a los que obtuvieron en el VI Programa Marco de I+D. Dichas actuaciones estarán recogidas en un Plan de Actuación Estratégico (PAE) elaborado por el centro tecnológico.

INNOEUROPA se estructura en dos fases: En la primera fase se hará un primer pago anticipado de la ayuda concedida, destinado a financiar los gastos necesarios para alcanzar los objetivos establecidos en el PAE. En la segunda fase, que tendrá lugar al año siguiente, recibirán el resto de la ayuda concedida, en función del grado de cumplimiento del objetivo de retorno fijado en el PAE, como prima por los objetivos conseguidos.