El Artículo 85 del Real Decreto 887/2006, de 21 de julio, por el que se aprueba el Reglamento de la Ley 38/2003, de 17 de noviembre, General de Subvenciones, establece que los órganos concedentes de subvenciones, tienen la obligación de elaborar anualmente un plan anual de actuación para comprobar la realización por los beneficiarios de las actividades subvencionadas. De acuerdo a dicho artículo, el citado plan deberá indicar si la obligación de comprobación alcanza a la totalidad de las subvenciones o bien a una muestra de las concedidas.

Hasta el año 2022, los planes anuales elaborados por la AEI alcanzaban la totalidad de las subvenciones. En el Plan Anual de Actuación de 2022, por primera vez, la Agencia realizará la comprobación sobre una muestra de las subvenciones concedidas. Las comprobaciones iniciadas de acuerdo a los planes de años anteriores, continuarán su tramitación con el criterio y alcance que se determinó en los planes respectivos.

La muestra de las comprobaciones que se inicien conforme al Plan de 2022 se seleccionará en base a un análisis de riesgos que tendrá en cuenta el volumen de ayuda recibida por cada beneficiario, el tipo de financiación recibida y un factor aleatorio, revisando al menos un 20% del importe concedido en cada convocatoria. 

Para el año 2022 el alcance de comprobaciones de justificaciones económicas se realizará sobre las siguientes convocatorias:

• Convocatoria 2012: Apoyo a Centros de Excelencia “Severo Ochoa”
• Convocatorias 2013: Ayudas para contratos predoctorales para la formación de doctores, Ramón y Cajal y Proyectos de I+D excelencia y Retos.
• Convocatorias 2014: Ayudas para contratos predoctorales para la formación de doctores, Ramón y Cajal, Doctorados industriales, Proyectos de I+D Excelencia, Proyectos de I+d+i Retos.
• Convocatorias 2015: Ayudas para contratos predoctorales para la formación de doctores, Incorporación estable de doctores, Ramón y Cajal, Juan de la Cierva Formación, Juan de la Cierva Incorporación, Técnicos de Apoyo, Torres Quevedo, Doctorados industriales, Ayudas a Proyectos Retos Colaboración, Proyectos de I+D Excelencia, Proyectos de I+d+i Retos, Explora Ciencia y Tecnología.
• Convocatorias 2016: Ayudas para contratos predoctorales para la formación de doctores, Incorporación estable de doctores, Ramón y Cajal, Juan de la Cierva Formación, Juan de la Cierva Incorporación, Técnicos de Apoyo, Torres Quevedo, Ayudas a Proyectos Retos Colaboración, Proyectos de I+D Excelencia, Proyectos de I+d+i Retos, Proyectos I+D+I «Programación conjunta internacional», Redes de excelencia, Acciones de Dinamización «Europa excelencia».
• Convocatorias 2017: Estancias breves, Juan de la Cierva Formación, Juan de la Cierva Incorporación, Técnicos de Apoyo, Torres Quevedo, Ayudas a Proyectos Retos Colaboración, Proyectos de I+D Excelencia, Proyectos de I+d+i Retos, Explora Ciencia y Tecnología, Acciones de Dinamización «Europa Investigación».
• Convocatorias 2018: Adquisición de Equipamiento Científico Técnico, Ayudas para la promoción de empleo joven e implantación de la Garantía Juvenil en I+D+i.
• Convocatorias 2019: Adquisición de Equipamiento Científico Técnico, Europa Centros Tecnológicos.
• Convocatoria 2020: Ayudas a Plataformas tecnológicas y de innovación.